🧬 · LibreGene - 开源跨平台质粒编辑器

Posted on 2026/8/15

🔗 GitHub　🔗 GitCode

LibreGene 是我开发的一款轻量级跨平台桌面质粒编辑器，使用 Tauri v2 构建，纯 SVG 渲染，完全开源（GPL v3）。

主要功能：

• 特征标注：CDS / mRNA 特征自动翻译，氨基酸直接渲染在序列下方；粘贴序列可自动检测常见特征（启动子、抗性标记、ori、标签等）；支持双链六读框 ORF 搜索
• 引物设计：引物与模板逐碱基比对，错配、退火区、Tm 值一目了然；支持片段扩增、重叠延伸 PCR（OE-PCR）和定点诱变，可加酶切位点尾巴
• 密码子优化：内置 9 个物种的密码子使用表，支持最优密码子、频率匹配、相对密码子适应度协调三种策略，优化前后 CAI 与 GC% 对比预览
• 限制性内切酶：内置 900+ 酶数据库，支持甲基化感知过滤，唯一切点、双切点、平末端和 IIS 型酶分类显示
• 序列比对：可导入 Sanger 测序结果（.ab1）、FASTA 和 GenBank 序列，与参考序列比对并高亮错配、插入和缺失
• 更多：SVG 质粒图谱、插件系统、多项目标签页、完整撤销 / 重做、GenBank / SnapGene 读写

此外，LibreGene 内置了 MCP 服务器（仅监听本机回环，Bearer token 鉴权），终端里的 LLM Agent 可以像真实用户一样操作已打开的质粒，UI 实时同步更新。

项目地址：https://github.com/dl-li/LibreGene （GitHub） / https://gitcode.com/dl-li/LibreGene （GitCode）